l ELISPOT 圖像分析儀(ELISPOT Reader)發(fā)展簡(jiǎn)史
要實(shí)現(xiàn)這個(gè)過(guò)程的自動(dòng)化,我們很容易想到顯微照相技術(shù)、圖像處理技術(shù)以及計(jì)算機(jī)人工智能技術(shù)。把它們綜合到一起,這就是ELISPOT圖像分析儀。1992年,德國(guó)萊卡公司推出了第一臺(tái)ELISPOT圖像分析儀。正如上世紀(jì)60年代發(fā)明的第一臺(tái)計(jì)算機(jī)占地幾百平方米,且性能低下一樣。萊卡公司推出的第一代ELISPOT圖像分析儀,僅計(jì)算機(jī)就占據(jù)一張實(shí)驗(yàn)臺(tái)的位置,數(shù)據(jù)采集部分使用了復(fù)雜的電視攝像系統(tǒng)。這臺(tái)儀器體積龐大,效率低下。在90年代初期,ELISPOT技術(shù)并未受到重視,因而ELISPOT圖像分析儀也沒(méi)有得到推廣。不到一年時(shí)間,萊卡公司就放棄了這一產(chǎn)品。1995年,隨著荷蘭Utrecht大學(xué)免疫研究所的Schielen P.(Schielen P et. al., 1995)首先引入PVDF膜到ELISPOT技術(shù)中,使得ELISPOT的可靠性和簡(jiǎn)便性提高,ELISPOT技術(shù)逐漸受到重視,相應(yīng)的ELISPOT文獻(xiàn)大量涌現(xiàn)。眾多科研工作者迫切需要能夠自動(dòng)讀ELISPOT板的設(shè)備,因此在1995年到1997年間,出現(xiàn)了數(shù)家生產(chǎn)ELISPOT圖像分析儀的廠家。
1995年出現(xiàn)的ELISPOT圖像分析儀廠家以德國(guó)卡爾蔡司公司,德國(guó)Bio-Sys公司,美國(guó)CTL公司,和德國(guó)AID公司為代表。對(duì)于如何識(shí)別PVDF膜板上的ELISPOT斑點(diǎn),這些廠家分成兩派:1)德國(guó)卡爾蔡司公司和德國(guó)Bio-Sys公司。這兩家生產(chǎn)商延續(xù)了德國(guó)萊卡公司的思路,依然采用顯微攝像系統(tǒng)來(lái)識(shí)別ELISPOT斑點(diǎn)。這種思路保持了PVDF膜板的完整性,強(qiáng)調(diào)對(duì)每一個(gè)孔的準(zhǔn)確定位。2)德國(guó)AID公司和美國(guó)CTL公司。由于PVDF膜板在構(gòu)造上的特殊性,PVDF膜與塑料板壁之間是可撕裂的。這兩家公司從而產(chǎn)生了新的思路:采用粘貼紙將PVDF膜粘附,再將其從塑料板壁上撕下。這樣就將識(shí)別在板上的ELISPOT斑點(diǎn)的問(wèn)題變成了識(shí)別在平面上的ELISPOT斑點(diǎn)的問(wèn)題。而識(shí)別平面上的ELISPOT斑點(diǎn)可以直接以掃描儀來(lái)進(jìn)行。
在上個(gè)世紀(jì)90年代中期,通過(guò)掃描來(lái)進(jìn)行ELISPOT斑點(diǎn)的識(shí)別是一個(gè)重要的技術(shù)進(jìn)步。第一,掃描相對(duì)于攝像大大提高了分析速度;第二,掃描模式直接繞過(guò)了如何定位96孔板上的每一個(gè)孔的難題;第三,在價(jià)格上掃描系統(tǒng)只相當(dāng)于攝像系統(tǒng)的三分之一或者更低,從而使得大多數(shù)實(shí)驗(yàn)室都能夠購(gòu)買(mǎi)ELISPOT圖像分析儀。但是基于掃描系統(tǒng)的ELISPOT圖像分析儀也有其固有的缺點(diǎn)。首先,掃描儀的分辨率非常低,隨著ELISPOT檢測(cè)方法應(yīng)用范圍迅速擴(kuò)大,某些實(shí)驗(yàn)中產(chǎn)生的ELISPOT斑點(diǎn)很小,掃描儀完全無(wú)法識(shí)別。雖然掃描儀本身的分辨率也在不斷提高,但和顯微攝像系統(tǒng)相比,始終要低1-2個(gè)數(shù)量級(jí)。其次,將PVDF膜板底部的PVDF膜撕下來(lái)掃描的做法是有其不妥之處:某些時(shí)候直接導(dǎo)致部分結(jié)果丟失,同時(shí)也不利于數(shù)據(jù)長(zhǎng)期保存。第三,其應(yīng)用受限于以膜為底的ELISPOT板,當(dāng)90年代末期,ELISPOT透明塑料板出現(xiàn)時(shí),這種基于掃描的ELISPOT圖像分析儀在應(yīng)用上大大受阻。
在ELISPOT圖像分析儀的發(fā)展史上,90年代末期出現(xiàn)的數(shù)碼技術(shù)是重要的技術(shù)進(jìn)步。數(shù)碼識(shí)別技術(shù)與計(jì)算機(jī)人工智能的結(jié)合使得體積小、功能強(qiáng)大的ELISPOT圖像分析儀成為可能。當(dāng)數(shù)碼技術(shù)出現(xiàn)以后,德國(guó)AID公司和美國(guó)CTL公司迅速拋棄了其原有的基于掃描系統(tǒng)的ELISPOT圖像分析儀,重新投向以攝像系統(tǒng)為基礎(chǔ)的ELISPOT圖像分析儀。在今天的ELISPOT圖像分析儀市場(chǎng)上,ELISPOT掃描系統(tǒng)只剩下部分90年代的庫(kù)存產(chǎn)品。這就是技術(shù)進(jìn)步的重大力量。
由于數(shù)碼識(shí)別技術(shù)的出現(xiàn),始終堅(jiān)持通過(guò)顯微攝像識(shí)別ELISPOT斑點(diǎn)這一技術(shù)路線的德國(guó)卡爾蔡司公司和德國(guó)Bio-Sys公司從此一直走在ELISPOT圖像分析儀市場(chǎng)的前端。在具體的技術(shù)路線上,兩家公司又略有不同。德國(guó)卡爾蔡司公司希望突出其高精密的顯微鏡頭,力求在成像上做到能夠識(shí)別PVDF膜上的每一個(gè)小的斑點(diǎn)。但是其缺陷也非常明顯:第一,要達(dá)到此目的,只能通過(guò)放大圖像來(lái)實(shí)現(xiàn),這樣就不可能在一副圖像上包括整個(gè)完整孔底。卡爾蔡司公司通過(guò)軟件拼接的方法,將多幅放大圖像拼成一幅包括大部分孔底的圖像,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)整個(gè)孔中的ELISPOT斑點(diǎn)進(jìn)行計(jì)數(shù)。這樣的結(jié)果是:圖像出現(xiàn)明顯的拼接痕跡,同時(shí),在拼接縫部分的斑點(diǎn)識(shí)別,以及在孔邊緣的斑點(diǎn)識(shí)別也都同時(shí)成為了亟待解決確又難以解決的問(wèn)題。第二,更關(guān)鍵的是,由于ELISPOT實(shí)驗(yàn)過(guò)程涉及細(xì)胞,細(xì)胞碎片、自發(fā)分泌、非特異分泌、顯色問(wèn)題等多種情況,都會(huì)在PVDF膜上留下斑點(diǎn)或者花紋。因此,ELISPOT斑點(diǎn)識(shí)別的一個(gè)關(guān)鍵的問(wèn)題是對(duì)真假斑點(diǎn)的識(shí)別。熟悉ELISPOT技術(shù)的實(shí)驗(yàn)者都有共識(shí),一個(gè)正常的ELISPOT斑點(diǎn)在大小上通常不會(huì)小于20μm。因此,關(guān)注于對(duì)小的斑點(diǎn)都能清晰識(shí)別,在生物學(xué)上并沒(méi)有太大的實(shí)際意義,反而因?yàn)樵黾恿诵“唿c(diǎn)的識(shí)別影響了對(duì)真正的ELISPOT斑點(diǎn)的識(shí)別。第三,也是不可忽視的一點(diǎn):卡爾蔡司公司的ELISPOT圖像分析儀是市場(chǎng)上價(jià)格昂貴的設(shè)備,是其他廠商同類型設(shè)備的兩倍以上!
l 德國(guó)ByoSys公司的Bio-Reader系列
德國(guó)Bio-Sys公司從上世紀(jì)80年代開(kāi)始就致力于生物圖像識(shí)別領(lǐng)域,在進(jìn)入ELISPOT圖像分析儀市場(chǎng)后一直以其先進(jìn)的ELISPOT斑點(diǎn)識(shí)別技術(shù)聞名。德國(guó)Bio-Sys公司首先解決了顯微攝像系統(tǒng)難以定位96孔板上的每一個(gè)孔的問(wèn)題。其解決方法基于圖像識(shí)別技術(shù),利用板孔邊壁和真正的孔底的細(xì)微差別,在機(jī)械定位的基礎(chǔ)上,通過(guò)軟件識(shí)別來(lái)進(jìn)一步提高每孔的定位精度。是目前市場(chǎng)上所有ELISPOT圖像分析儀中唯一能夠完整識(shí)別整個(gè)孔底ELISPOT斑點(diǎn)圖像的設(shè)備。在對(duì)真假斑點(diǎn)的分辨中,德國(guó)Bio-Sys公司除了具備完善的物理學(xué)多參數(shù)識(shí)別技術(shù),還特別針對(duì)ELISPOT斑點(diǎn)形成的生物學(xué)過(guò)程,通過(guò)細(xì)胞因子顯色后的“光密度”峰值積分分析方法,精確分辨真假斑點(diǎn)、融合斑點(diǎn)等復(fù)雜情況。Bioreader系列ELISPOT圖像分析儀國(guó)外大多數(shù)較有經(jīng)驗(yàn)的ELISPOT實(shí)驗(yàn)室推崇的特點(diǎn)為:專業(yè)性和參數(shù)全開(kāi)放性。因?yàn)镋LISPOT實(shí)驗(yàn)的復(fù)雜性,ELISPOT斑點(diǎn)形成在不同的實(shí)驗(yàn)條件下有非常大的差異。這就對(duì)ELISPOT圖像分析儀提出了較高的要求:既要能夠保證斑點(diǎn)計(jì)數(shù)的真實(shí)性和一致性,又要能夠根據(jù)不同情況,通過(guò)實(shí)驗(yàn)者的判斷來(lái)校正儀器對(duì)ELISPOT斑點(diǎn)識(shí)別的標(biāo)準(zhǔn)。要同時(shí)實(shí)現(xiàn)以上兩個(gè)要求,唯一的辦法是將儀器的所有判斷標(biāo)準(zhǔn)向ELISPOT實(shí)驗(yàn)者開(kāi)放,實(shí)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)者和儀器的互動(dòng)。在這一方面,德國(guó)Bio-Sys公司始終走在ELISPOT斑點(diǎn)識(shí)別領(lǐng)域的前列,新的Bioreader-4000型(圖8.3)和Bioreader -5000(圖8.4) 型在專業(yè)性和適用性方面都領(lǐng)先于其他廠家的設(shè)備。
l ELISPOT 圖像分析儀的發(fā)展和展望
近幾年,ELISPOT圖像分析儀的應(yīng)用在向兩個(gè)方向發(fā)展。
第一, 作為斑點(diǎn)識(shí)別類型的儀器,ELISPOT圖像分析儀在努力地開(kāi)辟在其它斑點(diǎn)識(shí)別領(lǐng)域的應(yīng)用。
在這個(gè)方面做的較好的是德國(guó)Bio-Sys公司的Bioreader系列。受惠于Bioreader在光源照明設(shè)計(jì)和軟件參數(shù)開(kāi)放兩方面的優(yōu)點(diǎn),德國(guó)Bio-Sys公司的ELISPOT圖像分析儀只需在參數(shù)上進(jìn)行調(diào)整,就可以對(duì)6孔板、24孔板、96孔板等板型上的病毒斑、溶血空斑、腫瘤細(xì)胞克隆斑等實(shí)體斑點(diǎn)或者空斑點(diǎn)進(jìn)行識(shí)別,大大擴(kuò)展了儀器本身的應(yīng)用。
第二, 對(duì)雙色、多色、以及熒光FluoroSpot的識(shí)別。
隨著ELISPOT技術(shù)本身的發(fā)展,研究者不再滿足于現(xiàn)有的對(duì)單一細(xì)胞因子分泌所形成的ELISPOT斑點(diǎn)的識(shí)別。雙色或多色ELISPOT技術(shù)就此產(chǎn)生。簡(jiǎn)而言之,雙色或多色ELISPOT即檢測(cè)同一細(xì)胞同時(shí)分泌兩種或以上的細(xì)胞因子的技術(shù)。舉個(gè)例子,如果以紅色顯色劑顯示IFN-γ的分泌,以藍(lán)色顯色劑顯示IL-2的分泌,在同一個(gè)孔中,就可以通過(guò)這兩個(gè)顯色系統(tǒng)分辨:有多少細(xì)胞只分泌IFN-γ(紅色斑點(diǎn)),只分泌IL-2(藍(lán)色斑點(diǎn)),和同時(shí)分泌這兩種細(xì)胞因子(棕色斑點(diǎn))。
但是,原理上很簡(jiǎn)單的雙色或多色ELISPOT技術(shù)在實(shí)際應(yīng)用中遇到了很大的困擾。這就是關(guān)于混色ELISPOT斑點(diǎn)的識(shí)別問(wèn)題。具體到每個(gè)細(xì)胞,如果有兩個(gè)顯色系統(tǒng)同時(shí)顯色:部分紅色/部分藍(lán)色,以及其間的各種組合,都會(huì)導(dǎo)致不同的顏色;斑點(diǎn)的不同顯色區(qū)域,可能以紅色為主,也可能以藍(lán)色為主,無(wú)法均一定義;先分泌某種細(xì)胞因子,后分泌某種細(xì)胞因子,可能會(huì)產(chǎn)生覆蓋等諸多問(wèn)題。這些問(wèn)題都導(dǎo)致混色ELISPOT斑點(diǎn)難于識(shí)別。在這個(gè)方面,目前還沒(méi)有一個(gè)很好的解決辦法,從而也限制了雙色或多色ELISPOT技術(shù)的應(yīng)用。從實(shí)際使用中來(lái)看,有少部分科研工作者在使用雙色ELISPOT技術(shù),通常為探索性的研究;而多色ELISPOT技術(shù),幾乎沒(méi)有人使用。
與之相對(duì)應(yīng),ELISPOT圖像分析儀在這個(gè)方面也只是具備基本的功能。大多數(shù)ELISPOT圖像分析儀采用RGB(紅、綠、藍(lán))三色定義方案來(lái)識(shí)別多色斑點(diǎn)。RGB三色定義方案采用固定紅、綠、藍(lán)濾鏡,通過(guò)對(duì)一種顏色斑點(diǎn)的遮蓋來(lái)識(shí)別其他所有顏色斑點(diǎn)。從理論上講,在情況下多能夠識(shí)別三色斑點(diǎn)的ELISPOT。但實(shí)際應(yīng)用中,顯色系統(tǒng)的不同實(shí)驗(yàn)條件會(huì)導(dǎo)致不同的顏色。比如:AEC顯色系統(tǒng)從理論上為標(biāo)準(zhǔn)紅色,但實(shí)際上根據(jù)實(shí)驗(yàn)條件的不同,其顯色從橙黃到正紅到紫紅。其他顯色系統(tǒng)也有類似的問(wèn)題。如果兩種或以上顯色系統(tǒng)共同作用,其混色斑點(diǎn)的顏色千變?nèi)f化,絕對(duì)不是簡(jiǎn)單用紅、綠、藍(lán)三色固定濾鏡能夠分辨的。如何解決這個(gè)問(wèn)題,只有在顏色定義方案上下功夫,在這個(gè)方面,德國(guó)Bio-Sys公司的顏色解決方案相對(duì)較好。德國(guó)Bio-Sys公司采用HLS(色度、亮度、飽和度)這一國(guó)際新的顏色定義方案,理論上可自定義十萬(wàn)種以上顏色,用于濾鏡識(shí)別。在針對(duì)單色顯色系統(tǒng)和多色顯色系統(tǒng)因各種原因?qū)е路菢?biāo)準(zhǔn)顏色的識(shí)別上相對(duì)準(zhǔn)確。當(dāng)然該系統(tǒng)也有其自身的不足:對(duì)于斑點(diǎn)與斑點(diǎn)之間、孔與孔之間、板與板之間的顏色變化,不能自動(dòng)適應(yīng),自動(dòng)調(diào)節(jié)。對(duì)于顏色自動(dòng)識(shí)別,這是一個(gè)普遍的難題,目前沒(méi)有一種技術(shù)能夠做到。
ELISPOT技術(shù)如果需要向多細(xì)胞因子檢測(cè)的方向發(fā)展,就必須解決多顯色系統(tǒng)同時(shí)顯色的問(wèn)題。既然混色識(shí)別是一個(gè)難以跨越的難題,一些ELISPOT試劑生產(chǎn)商自然向熒光顯色方向發(fā)展,這就是熒光耦聯(lián)免疫斑點(diǎn)技術(shù)(FluoroSpot)。由于采用熒光發(fā)光標(biāo)記,而不是顯色劑沉淀顯色,熒光耦聯(lián)免疫斑點(diǎn)(FluoroSpot)從誕生之日起,就天然的解決了多系統(tǒng)同時(shí)顯色的問(wèn)題。同時(shí)由于熒光發(fā)射光波長(zhǎng)具有唯一性,其顏色不因?qū)嶒?yàn)條件的變化而變化。FluoroSpot從2005年出現(xiàn)以來(lái),在敏感性、特異性等方面已經(jīng)達(dá)到或超過(guò)ELISPOT,目前更大的難題在于長(zhǎng)期保存的問(wèn)題,限制了其商業(yè)化進(jìn)程。但是,F(xiàn)luoroSpot作為多細(xì)胞因子檢測(cè)的必然發(fā)展方向,已經(jīng)在ELISPOT領(lǐng)域的科學(xué)工作者中達(dá)到共識(shí)。與之相配合,熒光耦聯(lián)免疫斑點(diǎn)(FluoroSpot)圖像分析儀也在2005年底首先由德國(guó)Bio-Sys公司正式推出市場(chǎng),并在加拿大實(shí)現(xiàn)全世界首臺(tái)FluoroSpot圖像分析儀的銷(xiāo)售和應(yīng)用。
我們可以預(yù)測(cè),隨著FluoroSpot技術(shù)的成熟和FluoroSpot圖像分析儀的成熟,F(xiàn)luoroSpot必然逐漸取代目前的ELISPOT技術(shù),并使得免疫斑點(diǎn)技術(shù)真正成為以高通量、多因子、高靈敏、和高穩(wěn)定性為特征的細(xì)胞免疫檢測(cè)技術(shù)。而免疫斑點(diǎn)圖像分析儀的不斷發(fā)展也大力地推動(dòng)了該技術(shù)在免疫學(xué)、病毒學(xué)、腫瘤學(xué)、以及臨床檢測(cè)中的廣泛應(yīng)用。