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如何提高噬菌體展示文庫(kù)的庫(kù)容?

作者:admin 信息來(lái)源:達(dá)科為 日期:20210819 打印 字體:  
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噬菌體展示技術(shù)將基因型和表型統(tǒng)一于同一噬菌體顆粒,相較于傳統(tǒng)的抗體制備技術(shù),提供了不經(jīng)免疫制備抗體的可能,可以解決因?yàn)槿蹩乖⒆陨砜乖?、具有毒性的抗原等抗體制備的困難。因此也是目前抗體庫(kù)制備中應(yīng)用十分廣泛的一項(xiàng)技術(shù)。

一個(gè)好的噬菌體抗體庫(kù)需要具備較大的容量和良好的多樣性,如果庫(kù)容量較小,則難以獲得高親和力的抗體。那么想要獲得較大庫(kù)容和多樣性豐富的噬菌體文庫(kù),有哪些可以優(yōu)化的因素呢?
 

一、選擇高轉(zhuǎn)化效率的大腸桿菌(感受態(tài)細(xì)胞)

噬菌體文庫(kù)的庫(kù)容會(huì)受大腸桿菌轉(zhuǎn)化效率的限制,選擇高效率的電轉(zhuǎn)感受態(tài)細(xì)胞,能有效的增加噬菌體文庫(kù)的庫(kù)容,另外也可以通過(guò)增加轉(zhuǎn)化次數(shù)來(lái)累積庫(kù)容。在噬菌體展示文庫(kù)構(gòu)建過(guò)程中,使用比較多的感受態(tài)細(xì)胞有TG1、XL1-Blue、SS320等。

在進(jìn)行轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)時(shí),要想獲得高的轉(zhuǎn)化效率,質(zhì)粒/連接產(chǎn)物的純度、電轉(zhuǎn)的條件、質(zhì)粒/連接產(chǎn)物的加入量以及操作的規(guī)范性也是需要注意的地方。


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試用福利

達(dá)科為生物代理的LGC(Lucigen)提供轉(zhuǎn)化效率≧4×1010 cfu/μg的噬菌體文庫(kù)構(gòu)建感受態(tài)細(xì)胞~


申請(qǐng)方式

1、關(guān)注“分子技術(shù)達(dá)論”微信公眾號(hào),回復(fù)“感受態(tài)細(xì)胞”

2、填寫(xiě)相關(guān)信息,審核通過(guò)即可免費(fèi)獲得試用裝?。總€(gè)用戶僅限申請(qǐng)一次,已購(gòu)買過(guò)該產(chǎn)品的用戶不參與此次活動(dòng))


試用產(chǎn)品信息

高效噬菌體文庫(kù)構(gòu)建感受態(tài)——Phage Display ElectroCompetent Cells



  • 試用裝包含3種電轉(zhuǎn)感受態(tài)細(xì)胞【TG1, SS320 (MC1061 F'), ER2738】,每種感受態(tài)各4個(gè)反應(yīng);

  • 1、抗體或多肽噬菌體展示庫(kù)構(gòu)建的最佳選擇;

  • 2、最高轉(zhuǎn)化效率的TG1感受態(tài)細(xì)胞,轉(zhuǎn)化效率≧4×1010 cfu/μg;

  • 3、具有琥珀和非琥珀抑制基因的靈活性選擇;

  • 4、生成更大的基因文庫(kù),加速研究發(fā)現(xiàn)。


 

更多感受態(tài)細(xì)胞試用裝


 

二、輔助噬菌體投入量的優(yōu)化及改造

噬菌體擴(kuò)增的最終目的是將噬菌粒中單一拷貝的抗體片段基因通過(guò)噬菌體的擴(kuò)增過(guò)程變成10-100個(gè)拷貝。不同文庫(kù)大小的噬菌體庫(kù)在擴(kuò)增過(guò)程中需要的擴(kuò)增體積是不一樣的,要想獲得大庫(kù)容的噬菌體文庫(kù),以下條件需要提前進(jìn)行計(jì)算評(píng)估。

1、擴(kuò)增過(guò)程中含有噬菌粒的大腸桿菌的數(shù)目和體積;

2、對(duì)應(yīng)加入多少輔助噬菌體進(jìn)行有效感染(一般輔助噬菌體和TG1的比值MOI在10-20:1時(shí)能保證所有的TG1被感染上);

3、擴(kuò)增后加入多少含有噬菌粒的噬菌體進(jìn)行淘選(如果輔助噬菌體的展示效率只有10%,那最后要保證噬菌體抗體庫(kù)中每個(gè)抗體有10-100個(gè)抗體拷貝數(shù)的話,輔助噬菌體的投入量就應(yīng)該是文庫(kù)大小的100-1000倍)


注:輔助噬菌體在TG1處于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期時(shí)有比較好的感染效率,TG1處于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的OD600值在0.4-0.8。(1OD代表的菌濃度為1×109個(gè)/ml)。

 

另外,我們也可以選擇展示效率較高的輔助噬菌體,比如gIII基因缺失的Hyperphage(Progen, cat#PRHYPE),它能使得抗體或多肽在噬菌體展示的拷貝數(shù)增多(up to 5 vs. 0.01) ,從而提高淘選的效率。


 

 

三、采用體內(nèi)重組技術(shù)進(jìn)一步增加噬菌體文庫(kù)的庫(kù)容和多樣性

Cre-loxp體內(nèi)重組系統(tǒng)可以有效增大抗體庫(kù)的庫(kù)容性,并且在對(duì)文庫(kù)進(jìn)行的每一輪篩選中,所有的抗體都可以再次進(jìn)行重組,保證了抗體庫(kù)的多樣性,因此該技術(shù)也為高容量抗體庫(kù)的發(fā)展提供了有利的工具。近期,YUAN DONG[1]等利用CreLoxP重組技術(shù)構(gòu)建了人源的scFv噬菌體文庫(kù),并對(duì)antiPCSK9抗體進(jìn)行了篩選。

 

參考文獻(xiàn)

[1] YUAN DONG, FANWEI MENG,et.al. Construction and application of a human scFv phage display library based on CreLoxP recombination for antiPCSK9 antibody selection. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOlecular medicine 47: 708-718, 2021.


 

Lucigen(美國(guó))公司成立于1998年,提供各類用于分子生物學(xué)研究相關(guān)產(chǎn)品,可以使研究者成功克隆較難克隆的基因。2017年Lucigen成為Epicentre Technologies基因組試劑盒、酶和輔助試劑的獨(dú)家經(jīng)銷商。2018年該公司被英國(guó)LGC收購(gòu),統(tǒng)一改名為Biosearch Technologies。目前產(chǎn)品線主要包括:體外轉(zhuǎn)錄、基因克隆(BAC克隆試劑盒)、感受態(tài)細(xì)胞(TG1噬菌體文庫(kù)構(gòu)建感受態(tài))、體外擴(kuò)增、轉(zhuǎn)座子突變、蛋白表達(dá)、核酸提取、BHQ?探針、Stellaris?RNA FISH等。


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