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哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)中,關(guān)于蛋白純化的難點(diǎn)和解決方案,了解一下!

作者:admin 信息來源:達(dá)科為 日期:20190614 打印 字體:  
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先前小達(dá)君給大家介紹了Strep-tag? 的歷史(點(diǎn)此回顧您想了解的Strep-tag:Strep-Tactin?XT發(fā)展史都在這里!),現(xiàn)在再隆重介紹 Strep-tag? 在哺乳類細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)的應(yīng)用。另外,小達(dá)君保證您看完后會(huì)心動(dòng),然后回來參加活動(dòng)(點(diǎn)此參加分享IBA蛋白純化體驗(yàn),獲贈(zèng)蛋白純化填料哦!),獲贈(zèng)蛋白純化填料哦!

雖然大腸桿菌E.coli表達(dá)系統(tǒng)經(jīng)濟(jì)實(shí)惠,但由于缺乏重要的脂類,分子螫合物,以及重要的翻譯后修飾,用它表達(dá)真核蛋白,可能會(huì)影響蛋白本身的折疊及功能,以膜蛋白為例,大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)能影響目標(biāo)蛋白在細(xì)胞膜的插入位置及其應(yīng)有的功能[1]。除此之外,當(dāng)目標(biāo)蛋白大于50kDa時(shí),使用大腸桿菌系統(tǒng)可能表達(dá)出不完整的蛋白[2]。

所以,為了研究特定蛋白的功能(如:信號(hào)通路),生產(chǎn)較大型的蛋白,或進(jìn)行高解析度的結(jié)構(gòu)分析,愈來愈多的實(shí)驗(yàn)室選擇哺乳類表達(dá)系統(tǒng)來生產(chǎn)融合蛋白。其原因?yàn)椴溉閯?dòng)物細(xì)胞生產(chǎn)出的重組蛋白與人類蛋白十分相似,有較完整的蛋白折疊、組合及翻譯后修飾[3]。因此,愈來愈多科學(xué)家們更加關(guān)注于—如何從哺乳類細(xì)胞中高效的純化目標(biāo)蛋白。

1.親和標(biāo)簽的選擇

首先,需考慮選擇合適的親和標(biāo)簽。常用于哺乳動(dòng)物表達(dá)系統(tǒng)的親和標(biāo)簽有His-tag、FLAG-tag、GST-tag及Strep-tag?等[4-12],整理于下表:

親和標(biāo)簽

氨基酸數(shù)量

配體

平衡解離常數(shù)(Kd) 范圍

洗脫方式

一步驟
純化純度

His-tag

2-10,

多為6

Ni2+-NTA, 
Co
2+-CMA

nM

Imidazole 20–250 mM或low pH

*

FLAG-tag,

3x FLAG

8,

22

抗Flag抗體

nM

pH 3.0;2–5 mM EDTA或FLAG短肽

***

Glutathione S-transferase (GST-tag)

211

Glutathione

nM

5–10 mM reduced glutathione

**

Strep-tag?II (ST),

Twin-Strep-tag? (TST)

8,

28

Strep-Tactin?

nM (with TST)

2.5 mM desthiobiotin

***

Strep-Tactin?XT

pM (with TST)

50 mM biotin

***

*這些親和標(biāo)簽在使用上各有千秋。

使用His-tag時(shí),常遇到的問題是寄主蛋白與填料的非特異性結(jié)合,在哺乳動(dòng)物重組蛋白的純化過程中,這樣的情況更為明顯。由于系統(tǒng)中有很多含有組氨酸(histidine)的殘基的蛋白,這種蛋白結(jié)構(gòu)與his-tag相似,容易與鎳柱結(jié)合,因此導(dǎo)致目標(biāo)蛋白純度降低[13]。

FLAG-tag系統(tǒng)可在非變性條件下進(jìn)行純化,能得到高純度、有活性的蛋白,但其缺點(diǎn)為純化介質(zhì)較為不穩(wěn)定,且純化成本高上許多[5]

另一常用的標(biāo)簽為GST-tag,一個(gè)26kDa的蛋白,其特點(diǎn)是表達(dá)量高,具高度抗原性,常用來增加目標(biāo)蛋白的溶解度,但常常會(huì)影響目標(biāo)蛋白的特性,一般推薦純化后將標(biāo)簽去除[8]。

而Strep-tag?(包含Strep-tag?II或是Twin-Strep-tag?),都是短肽標(biāo)簽,分別為8或28個(gè)氨基酸,一般不干擾蛋白折疊或活性,因此適合用于蛋白功能性研究[5]。Strep-tag?可以特異性地結(jié)合在Strep-Tactin?(二代介質(zhì))或Strep-Tactin?XT(三代介質(zhì))的生物素的結(jié)合位點(diǎn)。洗脫時(shí)使用的脫硫生物素(適用于二代)或生物素(三代),對(duì)同樣的結(jié)合位點(diǎn)有更高的親和力,能將目標(biāo)蛋白從同樣位置移除,因此得到的目標(biāo)蛋白純度一般高于95%[12]。

同時(shí),三代的 Strep-Tactin?XT與Strep-tag?蛋白的親和力大幅提升,直接加入含目標(biāo)蛋白的哺乳細(xì)胞的培養(yǎng)上清,即可高效純化出所需蛋白(注:原本使用二代需先以Avidin或是BioLock將培養(yǎng)基中的生物素遮蔽,才不會(huì)影響純化表現(xiàn))。

2.三代Strep-Tactin?XT親和力顯著

圖A比較了His-tag與Strep-tag?直接加入哺乳細(xì)胞培養(yǎng)上清純化目標(biāo)蛋白的表現(xiàn)。


圖A

圖A:分別向Strep-Tactin?XT High Capacity 1ml重力柱(左)和Ni-NTA 1ml重力柱(右)中,同時(shí)加入含4mg mCherry-Twin-Strep-tag (TST)或mCherry-His-tag (His)螢光蛋白的ExpiCHO細(xì)胞培養(yǎng)上清(注:接下來的實(shí)驗(yàn)皆是取哺乳細(xì)胞表達(dá)某抗體后的上清,另加入高純度目標(biāo)蛋白進(jìn)行實(shí)驗(yàn))。由圖可見,Strep-Tactin?XT(左)能高效率的捕捉mCherry-TST,而右方的mCherry-His幾乎無法掛柱。

此外,我們也測(cè)試了其他的蛋白,例如SEAP(72 kDa)或抗體(mAb,其重鏈為55kDa)。圖B為以Strep-Tactin?XT純化SEAP-TST、mCherry-TST與mAb-TST的SDS-PAGE分析結(jié)果,可見對(duì)于不同蛋白,Strep-tag?系統(tǒng)都能純化出高純度的目標(biāo)蛋白。(注:紅色標(biāo)記處為 mCherry的降解產(chǎn)物,非雜帶)


圖B

因Strep-Tactin?XT與Twin-Strep-tag蛋白的高親和力,即使目標(biāo)蛋白的濃度低,使用Strep-Tactin?XT仍可以有效的捕捉上清中的目標(biāo)蛋白。表C整理了幾個(gè)實(shí)驗(yàn)的數(shù)據(jù),顯示當(dāng)目標(biāo)蛋白濃度低于20μg/ml時(shí),得率仍能達(dá)到幾近100%。


表C

3.Strep-Tactin?XT普適性高

除了上述實(shí)驗(yàn)所用的CHO細(xì)胞株外(中國(guó)倉(cāng)鼠卵巢細(xì)胞),另一常用于生產(chǎn)蛋白的哺乳動(dòng)物細(xì)胞株為HEK293(人胚胎腎細(xì)胞),使用上較CHO簡(jiǎn)單。我們測(cè)試了Strep-Tactin?XT的純化表現(xiàn):表D1為以Expi293表達(dá)SEAP-TST或mAb-TST蛋白后,目標(biāo)蛋白的濃度。圖D2為純化表現(xiàn)的SDS-PAGE分析。從中可知,與ExpiCHO培養(yǎng)基相同,直接將表達(dá)好的Expi293上清加入1ml Strep-Tactin?XT高載量重力柱中進(jìn)行純化,一樣能夠快速的得到高純度的目標(biāo)蛋白。


表D1


圖D2

綜上所述,Strep-tag?非常適合用在哺乳動(dòng)物細(xì)胞系中表達(dá)目標(biāo)蛋白,其純化過程也與常見的ExpiCHO及Expi293培養(yǎng)基相容,不須另外處理,讓實(shí)驗(yàn)流程更為便利。加上Strep-tag?系統(tǒng)在純度上的優(yōu)勢(shì),是目前在這個(gè)應(yīng)用上的絕佳選擇。

4. IBA哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)/純化蛋白相關(guān)產(chǎn)品

產(chǎn)品信息

表E1 含Twin-Strep-tag?的哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)載體

名稱

貨號(hào)

Twin-Strep-tag?

分泌信號(hào)

規(guī)格

網(wǎng)站報(bào)價(jià)

N端

C端

pCSG-IBA105

5-5105-001



5ug

¥3,174

pESG-IBA105

5-4505-001



5ug

¥3,174

pCSG-IBA103

5-5103-001



5ug

¥3,174

pESG-IBA103

5-4503-001



5ug

¥3,174

pCSG-IBA104

5-5104-001


5ug

¥3,174

pESG-IBA104

5-4504-001


5ug

¥3,174

pCSG-IBA102

5-5102-001


5ug

¥3,174

pESG-IBA102

5-4502-001


5ug

¥3,174

表E2 pCSG與pESG的區(qū)別

載體系列/內(nèi)建基因

pCSG

pESG

CMV Promoter

oriP


EBNA-1


SV40 origin

NeoR

CoIE1 + Amp

BM40

表E3 IBA三代產(chǎn)品信息

名稱

貨號(hào)

規(guī)格

網(wǎng)站報(bào)價(jià)

Strep-Tactin?XT Superflow? 50%

suspension

2-4010-002

4 ml

¥1,365

2-4010-010

20 ml

¥4,814

2-4010-025

50 ml

¥11,437

Strep-Tactin?XT Superflow? gravity flow

columns

2-4011-005

5×0.2 ml

¥2,361

2-4012-001

1 ml

¥1,012

2-4013-001

5 ml

¥3,051

2-4014-001

10 ml

¥5,734

Strep-Tactin?XT Superflow? cartridges

(for ?kta/peristaltic pumps)

2-4021-001

1 ml

¥1,181

2-4022-001

5 ml

¥3,051

Strep-Tactin?XT Superflow? high

capacity 50% suspension

2-4030-002

4 ml

¥1,824

2-4030-010

20 ml

¥6,562

2-4030-025

50 ml

¥15,178

Strep-Tactin?XT Superflow? high

capacity gravity flow columns

2-4031-005

5×0.2 ml

¥3,051

2-4032-001

1 ml

¥1,365

2-4033-001

5 ml

¥4,186

2-4034-001

10 ml

¥7,880

Strep-Tactin?XT Superflow? high capacity cartridges (for ?kta/peristaltic pumps)

2-4025-001

1 ml

¥1,518

2-4026-001

5 ml

¥4,431

MagStrep "type3"XT beads 5% suspension

2-4090-002

2 ml

¥2,724

Strep-Tactin?XT Spin Column Kit

2-4151-000

1 kit

¥2,300

Strep-Tactin?XT immobilization plate

2-4101-001

1 plate

¥796

Twin-Strep-tag? Capture Kit

2-4370-000

1 kit

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參考文獻(xiàn)

[1] Sahdev S, Khattar SK, Saini KS (2008). Production of active eukaryotic proteins through bacterial expression systems: a review of the existing biotechnology strategies. Mol Cell Biochem., 307(1-2):249-64

[2] Dyson MR, Shadbolt SP, Vincent KJ, Perera RL, Mccafferty J (2004). Production of soluble mammalian proteins in Escherichia coli: identification of protein features that correlate with successful expression. BMC Biotechnol., 4:32. doi: 10.1186/1472-6750-4-32

[3] Khan KH (2013). Gene Expression in Mammalian Cells and its Applications. Adv Pharm Bull., 3(2): 257-63. doi: 10.5681/apb.2013.042

[4] Wegner GJ, Lee HJ, Corn RM (2002). Characterization and optimization of peptide arrays for the study of epitope-antibody interactions using surface plasmon resonance imaging. Anal Chem., 74(20):5161-8.

[5] Terpe K (2003). Overview of tag protein fusions: from molecular and biochemical fundamentals to commercial systems. Appl.Microbiol.Biotechnol.,60(5): 523-33. doi: 10.1007/s00253-002-1158-6

[6] Lichty JJ, Malecki JL, Agnew HD, Michelson-Horowitz DJ, Tan S (2005). Comparison of affinity tags for protein purification. Protein Expr Purif., 41(1):98-105.

[7] Tessema M, Simons PC, Cimino DF, Sanchez L, Waller A, Posner RG, Wandinger-Ness A, Prossnitz ER, Sklar LA (2006). Glutathione-S-transferase-green fluorescent protein fusion protein reveals slow dissociation from high site density beads and measures free GSH. Cytometry A., 69(5):326-34.

[8] Kimple ME, Brill AL, Pasker RL (2013). Overview of affinity tags for protein purification. Curr Protoc Protein Sci., 73: Unit 9.9. doi: 10.1002/0471140864.ps0909s73.

[9] GE Healthcare (2016). Affinity Chromatography Handbook, Vol. 2: Tagged Proteins.

[10] Thermo Fisher Scientific (2015). Protein Expression Handbook

[11] Dynamic Biosensors (2018) Application Note: High-affinity capturing of tagged proteins on the switchSENSE? biochip using Strep-Tactin?XT.

[12] IBA Lifesciences (2016) Application Note: Strep-Tactin?XT:Twin-Strep-tag?- Advantages compared to the His-tag purification system.

[13] Bornhorst JA, Falke JJ (2000). Purification of proteins using polyhistidine affinity tags. Methods Enzymol., 326:245-54.

IBA lifesciences(德國(guó)):IBA公司總部位于德國(guó)。二十年來,IBA以杰出的專利技術(shù)Strep-tag?系統(tǒng)為基礎(chǔ),發(fā)展出完整的產(chǎn)品組合,涵蓋重組蛋白表達(dá)純化與固定以及特定細(xì)胞從全血或相關(guān)體液中分離的技術(shù)。同時(shí),IBA也是全球領(lǐng)先的核酸合成專家,在DNA及RNA寡核苷酸的合成上已有超過二十年的經(jīng)驗(yàn),能根據(jù)客戶的選擇,生產(chǎn)含有特定染料或化學(xué)修飾的特殊寡核苷酸。


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